Федеральный проект по сохранению озера Байкал включает в себя комплекс мероприятий по снижению общей площади территорий, подвергшихся высокому и экстремально высокому загрязнению и оказывающих воздействие на озеро Байкал, модернизации и строительству очистных сооружений, необходимых для очистки загрязненных сточных вод, поступающих в озеро Байкал и другие водные объекты Байкальской природной территории, строительству сооружений инженерной защиты, а также по сохранению и воспроизведению уникальных водных биологических ресурсов озера Байкал. Кроме того, реализация проекта по сохранению озера Байкал предусматривает охват 93% площади Байкальской природной территории государственным мониторингом окружающей среды.

Единая система государственного экологического мониторинга (государственного мониторинга окружающей среды) включает в себя подсистемы:

• Государственного мониторинга состояния и загрязнения окружающей среды;
• Государственного мониторинга атмосферного воздуха;
• Государственного мониторинга радиационной обстановки на территории Российской Федерации;
• Государственного мониторинга земель;
• Государственного мониторинга земель сельскохозяйственного назначения;
• Государственного мониторинга объектов животного мира;
• Государственного лесопатологического мониторинга;
• Государственного мониторинга воспроизводства лесов;
• Государственного мониторинга состояния недр;
• Государственного мониторинга водных объектов;
• Государственного мониторинга водных биологических ресурсов;
• Государственного мониторинга внутренних морских вод и территориального моря Российской Федерации;
• Государственного мониторинга исключительной экономической зоны Российской Федерации;
• Государственного мониторинга континентального шельфа Российской Федерации;
• Государственного экологического мониторинга уникальной экологической системы озера Байкал;
• Государственного фонового мониторинга состояния многолетней (вечной) мерзлоты;
• Государственного мониторинга охотничьих ресурсов и среды их обитания.