Innerhalb der Grenzen des Baikal- NaturgebietNetz von Schutzgebieten (PAs) präsentiert fünf Reserven , vier Nationalparks, 21 Naturschutzgebieten , 128 Naturdenkmäler , einen botanischen Garten, Therapiegebiete und Urlaubsorten. Botanischer Garten von 27,1 Hektar in Irkutsk entfernt und ist von der Irkutsk State University verwaltet. Innerhalb der Grenzen des BNT hat sechs Erholungsgebieten - «Poberezhie Baikala» in Kaban und Pribaikalsky Bezirk «Baikal - Kultushnaya Surf» und «Lemasovo» in Kaban Bezirk, «Nord- Baikal» in Severobaykalsky Bereich «Barguzinsky Küste des Baikalsees» in Bargusinsky Bereich und «See Shchuchye» in Selenge Region. Diese Erholungsgebiete sind in der Republik Burjatien und der Verantwortung der Stadtverwaltungen entfernt.

Die Fläche des besonderen Schutzgebiets innerhalb des Naturgebiets Baikal beträgt 46,0 tausend Quadratkilometer, was 12% der Fläche des Naturgebiets Baikal und etwa 2,3% der Fläche aller besonderen Schutzgebieten der Russischen Föderation ausmacht. Innerhalb der Grenzen der zentralen ökologischen Zone Naturgebiet Baikal und des Gebiets des Weltnaturerbes «Baikalsee» besetzen die besondere Schutzgebiete 25,6 Tsd. qm. (29% der Fläche der zentralen Umweltzone).

Die Einrichtung und Funktionsweise von besonderen Schutzgebieten in der Russischen Föderation wird durch das Föderalgesetz vom 14. März 1995 Nr. 33 «Über besonders geschützte Naturgebiete» geregelt.

Im 2016 wurden durch das Föderalgesetz 254-FZ vom 03. Juli 2016 «Über die Änderung bestimmter Gesetze der Russischen Föderation» die Änderungen im Abs. 2 Art. 10. vorgenommen. In Übereinstimmung mit den Entscheidungen der Regierung der Russischen Föderation, können auf einem Teil des Territoriums der staatlichen Naturschutzgebiete die Biosphärenreservate geschafft werden. Durch das Föderalgesetz Nr. 486-FZ vom 28.12.2016 «Über die Änderung bestimmter Gesetze der Russischen Föderation» wurden die Änderungen vorgenommen, die insbesondere das Bildungssystem und die Verwaltung von dendrologischen Parks und botanischen Gärten betreffen:

− Die Erstellung von dendrologischen Parks und botanischen Gärten von föderaler Bedeutung erfolgt durch die Beschlüsse der Regierung der Russischen Föderation, die auf Empfehlung des von der Regierung der Russischen Föderation ermächtigten föderalen Exekutivorgans getroffen werden (Abs. 1, Artikel 28.1 «Verfahren zur Schaffung von dendrologischen Parks und botanischen Gärten»);

− Die Erstellung von dendrologischen Parks und botanischen Gärten von regionaler Bedeutung erfolgt durch die Beschlüsse des obersten Exekutivorgans der Staatsmacht eines Subjekts der Russischen Föderation mit Genehmigung eines Beschlusses zur Schaffung, Änderung des Sonderschutzregimes mit dem autorisierten föderalen Exekutivorgan im Bereich des Umweltschutzes, sowie mit der föderalen Behörde für Landesverteidigung und Staatssicherheit, wenn es davon ausgegangen wird, dass innerhalb der Grenzen von besonderen Schutzgebieten die Grundstücke und andere natürliche Ressourcen befinden, die für die Bedürfnisse der Streitkräfte der Russischen Föderation, Militäreinheiten und Körperschaften bereitgestellt werden (Art. 28.2 «Verfahren zur Schaffung von dendrologischen Parks und botanischen Gärten»). Die Aufgaben, die funktionale Zonierung sowie die Besonderheiten des Regimes des besonderen Schutzes jedes einzelnen Gebiet des dendrologischen Parks oder Botanischen Garten werden durch eine Verordnung über den dendrologischen Park oder den botanischen Garten festgestellt (Abs. 3 Artikel 29 «Sonderschutzregelung für Gebiete von dendrologischen Parks und botanischen Gärten»).

Der «jüngste nach» der Zeit der Gründung ist der nationale Naturpark "Tschikoi". Der Park wurde am 28. Februar 2014 durch die Verordnung der Regierung der Russischen Föderation Nr. 158 zum Schutz der Zedernwälder und der südsibirischen Taiga mit Elementen von Bergsteppen und Almwiesen im Oberlauf des Flusses Tschikoi gegründet. Der Park wurde bei der Beseitigung und dementsprechend mit der Aufnahme in seinen Bestand des Reservats von föderaler Bedeutung «Burkalsliy» und des Reservats von regionaler Bedeutung «Acinskiy» geschaffen. Der Nationalpark liegt im Hochland von Khentei-Daur im Oberlauf des Flusses Tschikoi (Baikal-Becken).

Im Jahr 2012 wurde die FGBU «Zapovednoye Pribaykalye» organisiert, die das Barguzinskiy Reservat, der Transbaikal-National Park und das Reservat Frolichinsky einschließt.

Im Jahr 2013 wurde die FGBU «Zapovednoye Pribaykalye» organisiert, die das Reservat Baikal-Lenskiy und den Nationalpark Baikal einschließt.

Die Tätigkeit von FGBU «Zapovednoye Podlemorye» und der FGBU «Zapovednoye Pribaykalye» wird in Übereinstimmung mit den Ihnen zugewiesenen Aufgaben in den Tätigkeitsbereichen durchgeführt: Erhaltung der natürlichen komplexe und Objekte, wissenschaftliche Forschung, ökologische und pädagogische Aktivitäten, die Schaffung von Bedingungen und Organisationen der Freizeit-und Tourismustätigkeit.